В 1985 году при Геологическим институте и Президиуме БФ СО АН СССР молодым к.г.н. А.К. Тулохоновым была создана группа аэрокосмических исследований.
В 1991 году на основе группы аэрокосмических исследований с привлечением приглашенных сотрудников был создан отдел мониторинга антропогенных и природных процессов, возглавляемый директором института д.г.н. Арнольдом Кирилловичем Тулохоновым.
Происходившие перемены в социально-экономическом развитии Байкальского региона, природопользовании, тенденции в развитии географической науки требовали применения новых направлений и методик исследования географической среды. В связи с чем и происходила корректировка названия лаборатории: в 1998 году – лаборатория мониторинга и экологического картографирования, в 1999 году – лаборатория геоэкологии, в 2000 году – лаборатория геоэкологии и экологического картографирования.
17 СОТРУДНИКОВ, В ТОМ ЧИСЛЕ 2 ДОКТОРА НАУК И 8 КАНДИДАТОВ НАУК
С 2008 года по настоящее время руководителем лаборатории геоэкологии является д.г.н. Ендон Жамьянович Гармаев. На протяжении 30 лет заместителями заведующего отдела, а потом лаборатории геоэкологии исполняли обязанности следующие научные сотрудники: 1991 – 1992 гг. – к.г.н. А.Б. Иметхенов; 1993 год – д.б.н. Б-Ц. Б. Намзалов; 1993 – 1996 гг. – к.б.н. Т.И. Абидуева; 1996 – 1997 гг. – к.г.-м.н. А.С. Ендрихинский; 1998 год – д.г.н. Т.Т. Тайсаев; 1999 год – к.г.н. В.В. Татарников; 2000 – 2003 гг. – вновь к.б.н. Т.И. Абидуева; 2003 – 2006 гг. – к.г.н. Л.Г. Намжилова; 2007 – 2019 гг. – к.г.н. С.Г. Андреев; с 2020 года по настоящее время – к.т.н. А.А. Аюржанаев.
За весь период в рамках лаборатории подготовлено и защищено 10 кандидатских диссертаций, двое сотрудников были избраны членами Российской академии наук: академик РАН Арнольд Кириллович Тулохонов (2016 год), профессор РАН (2015 год) и впоследствии член-корреспондент РАН (2019 год) Ендон Жамьянович Гармаев. Каждые 5 лет лаборатория являлась ответственной за проведение крупных научных мероприятий института. За весь период внебюджетных поступлений у лаборатории было около 70 контрагентов (от фондов Президента РФ, интеграционных проектов, программ РАН, иностранных фондов, до госконтрактов и хоздоговоров с государственными и коммерческими фирмами). Сейчас продолжается реализация гранта РНФ.